小程序的微信支付需要單獨申請，但是有兩種情況，一種用手機站+小程序功能；一種單獨開通小程序；
（手機站+小程序）的微信支付：小程序關聯(lián)手機站對接的認證服務號，認證服務號申請好微信支付，小程序也需要單獨認證、申請微信支付，申請的時候申請類型選擇“綁定已有商戶號開通微信支付”，如圖：
申請好之后直接在手機網(wǎng)站后臺配置好微信支付，小程序、手機站都可以直接使用微信支付方式了。
（單獨開通小程序）微信支付：單獨申請小程序賬號后去進行認證、申請微信支付，流程和公眾號微信支付的申請是相同的。小程序微信支付申請教程：http://kf.qq.com/faq/140225MveaUz161230yqiIby.html
申請好微信支付后。按照網(wǎng)站微信支付的配置教程來操作配置就可以正常使用的（單獨配置小程序的微信支付不需要設置支付授權目錄）微信支付配置教程：http://admin.dlszywz.cn/help_detail.php?id=1714928&channel_id=12401788&parent_id=620063
help_detail.php?id=1714928&channel_id=12401788&parent_id=620063
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